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高大上技術可有效識別單個癌細胞中的DNA突變
日,刊登在國際雜志Nature Methods上的一項研究報告中,來自德克薩斯大學MD安德森癌癥中心的研究人員開發了一種新型的計算機程序,其可以幫助有效鑒別出單一癌細胞中的DNA突變,該技術或許就可以幫助臨床醫生提高癌癥診斷的準確率,當然也為開發新型的癌癥個體化療法提供思路。
當前的新一代測序技術可以測定數百萬個細胞中的基因組,而這種名為Monovar方法的程序則可以對組織樣本中的重要基因突變進行檢測;Monovar技術的建立基于單細胞測序技術,單細胞測序技術不僅用于癌癥研究,還用于神經生物學、微生物學及**學領域的研究,Monovar作為基于單細胞測序的新型技術可以對單個細胞中基因組進行全方位分析,而不是數百萬個細胞。Monovar技術可以對細胞間的檢測結果進行對比,并且以極高的準確率來篩選出細胞間的不同,并不像單細胞測序那樣,Monovar技術可以發現非常輕微的DNA突變,比如單核苷酸多態性(SNVs),而這一技術將可有效改善特殊癌癥的診斷效率及準確性。
基于系統性的分析,Monovar算法可以從多個單一細胞中提取出相關數據來尋找SNVs,并且為每一個細胞提供非常詳細的遺傳數據。對SNVs的準確檢測對于病人的**和護理非常關鍵,因為SNVs會影響個體的患病過程以及對多種**和疫苗的反應,這些分子突變對于開發個體化療法起著決定性的作用。
研究者Ken Chen說道,Monovar技術可以分析大規模的數據并且處理不同的全基因組方案,因此其完全適用于多種類型的研究;利用該技術我們就可以在線檢查自己,相比其它標準方法而言,Monovar技術在檢測突變和遺傳變異上具有更高的準確性。在利用大數據和統計學分析工具進行癌癥領域研究方面這并不是**次了,來自全世界的多個實驗室都在收集大量的數據來揭示癌癥發生的機制以及如何開發特異性的療法進行**。
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